Tak lama kemudian, Southampton mencatat kemenangan 3-1 atas Manchester City yang berstatus juara bertahan Premier League. Hasil tersebut menjadi salah satu pencapaian penting Pochettino pada awal kariernya di Inggris.
Di bawah kepemimpinannya, Southampton terus berkembang. Setelah mengakhiri musim pertamanya di posisi ke-14, Pochettino membawa klub tersebut finis di peringkat kedelapan pada musim 2013/2014. Southampton bahkan hanya terpaut satu posisi dari Manchester United.
Perkembangan pesat itu membuat Tottenham Hotspur tertarik merekrutnya. Pochettino kemudian mengambil alih kursi kepelatihan klub London Utara tersebut.
Di Tottenham, reputasinya sebagai pelatih yang berani mengembangkan pemain muda semakin terlihat. Salah satu keputusan pentingnya adalah memberikan kepercayaan kepada Harry Kane.
Saat itu, Kane masih berjuang mendapatkan tempat utama di Tottenham dan beberapa kali dipinjamkan ke klub lain. Namun, di bawah arahan Pochettino, Kane berkembang menjadi salah satu penyerang terbaik dunia.






